Durante más de 12 años esta línea ha elaborado una base de datos referencial, "Clío", sobre las mujeres en la historia del Perú, que remite al usuario a libros, periódicos y folletos con información desde 1700 hasta 1930. Hace un tiempo nos propusimos migrar a un nuevo soporte más práctico y moderno, adicionando los documentos mismos, para promover y especialmente facilitar las investigaciones históricas sobre las mujeres peruanas. Luego de una cuidadosa selección del material correspondiente a cada uno de los 14 mil registros, llevada a cabo en la Biblioteca Nacional y de fotocopiar los documentos que se encontraban en otras bibliotecas, se estableció un convenio con dicho organismo para que realizara el escaneo de este profuso material. Este laborioso proceso originó 31 mil imágenes las cuales fueron depuradas en CENDOC-MUJER para eliminar duplicaciones y otros errores, que se plasmaron en un DVD, debido a su volumen. Este DVD, que ya se encuentra a la venta, contiene cerca de 12 mil imágenes de documentos y completa de esta manera nuestra base de datos "Clío" al enlazar las referencias con sus fuentes (fichas e imágenes), configurándose como una herramienta de primer nivel para realizar investigaciones. Su título es "Clío: 230 años de historia de las mujeres en el Perú, 1700-1930".


Para propiciar investigaciones de historia de las mujeres con perspectiva de género, se constituyó en 1994 el Taller Permanente de Historia como espacio de formación y debate de investigaciones históricas. Algunas de las investigaciones desarrolladas a partir de dicho espacio, sirvieron de base para organizar el Congreso "Mujeres y Género en la Historia del Perú", en 1996, del que se publicaron las actas, y posteriormente, en alianza con el Instituto Riva Agüero (PUCP), el Congreso  "Mujeres, familia y sociedad en la Historia de América Latina, siglos XVIII al XXI" llevado a cabo en el 2003, cuyas actas han sido reunidas en el libro del mismo nombre que se encuentra a disposición del público.

Hemos desarrollado investigaciones sobre la construcción de la feminidad y la masculinidad en la prensa ilustrada peruana (fines siglo XVIII), los cambios en las formas y espacios de la sociabilidad femenina en sectores populares de Lima (siglo XIX), y sobre la lucha de las mujeres por sus derechos (inicios del XX). Estas investigaciones han sido presentadas en congresos, tanto en universidades peruanas, como a nivel internacional, en las "Jornadas de Historia de Mujeres", realizada en Buenos Aires el año 2000 y en el Congreso "Passeurs Culturels" en Lima en el año 2002. Asimismo, a través de charlas y talleres se socializan los resultados y/o conocimiento de las últimas investigaciones de historia de las mujeres, para educadoras/es de Ciencias Sociales de diferentes colegios de Lima, como de otras ciudades del Perú.

Colección María Jesús Alvarado
María Jesús Alvarado Rivera nació el 27 de mayo de 1878 en Chincha (Lima, Perú). Como escritora, educadora y feminista, en 1911 expuso los fundamentos del feminismo como corriente de cambio social a nivel mundial, planteando la necesidad de otorgar derechos civiles y políticos a las mujeres. Organizó la primera asociación feminista "Evolución Femenina" y una escuela dirigida a niñas de escasos recursos. Formó parte de la Asociación Pro Indígena. Escribió numerosos artículos periodísticos sobre la educación, feminismo, indigenismo, eugenesia y dramas de profundo contenido social y moral. Organizó campañas a favor de cambios legales que permitiesen a las mujeres ocupar cargos en las Sociedades de Beneficencia, y que diesen la igualdad civil para las mujeres. Durante el Oncenio del presidente Augusto B. Leguía, sufrió cárcel y exilio en Argentina por sus ideas sociales. 
Gracias a la historiadora y feminista norteamericana Elsa Chaney, quien tuvo la oportunidad de entrevistar en 1967 a María Jesús Alvarado, se logró tomar contacto con la familia Alvarado Rivera, y con su sobrina y colaboradora, Dora Córdova. En 1987-88 CENDOC-MUJER realizó el ordenamiento e inventario de su colección, y la puso en valor a través de una exposición en la Biblioteca Nacional (marzo 1988). En 1994, la familia Alvarado Rivera entregó CENDOC-MUJER, en calidad de custodia, la colección completa de las obras y objetos personales de la primera feminista peruana, María Jesús Alvarado.

Colección Dora Mayer
Escritora, periodista y luchadora social, nació el 12 de marzo de 1868 en Alemania. Vino al Perú a la edad de 5 años y se inició en el periodismo en 1900, trabajando en los diarios El Comercio durante 40 años, La Prensa y La Crónica. Integró la Asociación Pro Indígena y fue delegada del Perú en el Primer Congreso Femenino Internacional, realizado en Buenos Aires, Argentina (1910). Publicó numerosas obras de sociología, de crítica literaria y de carácter filosófico. Murió en Lima en 1959.
En 1995 una historiadora donó al Centro de Documentación sobre la Mujer, parte de la colección de escritos de Dora Mayer, integrada por libros y artículos impresos y manuscritos, fotos y correspondencia familiar en alemán y español que mantuvo con personalidades de la época.